CMRI 利用 Oracle 云基础设施将成本降低 25%

澳大利亚研究机构采用 OCI 数据科学平台,由此获得灵活性和可伸缩性,发现新洞察,并更快地执行分析。

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A typical numerical simulation will take around 30 days with a small computer that already has a GPU.With Oracle Cloud Infrastructure Data Science, we can do the same simulation in about five days.

Pablo Galaviz澳大利亚儿童医学研究所高级数据科学家、生物信息学家

业务挑战

澳大利亚儿童医学研究所 (CMRI) 是澳大利亚知名的医学和生物研究所,也是一家注册慈善机构。

60 多年来,该研究所一直致力于提升儿童医疗保健能力。它拥有许多首创性的成就,比如澳大利亚第一家新生儿研究单位;利用显微外科技术帮助修复婴儿和儿童血管和器官;开展遗传疾病研究等。

该研究所的研究团队由 170 多名全职科学家和博士生组成,致力于为具有遗传性疾病的儿童提供更好的治疗和康复方案。其研究涵盖各种领域,包括癌症、神经生物学、胚胎学、基因组学和基因疗法,旨在为诊断和治疗提供支持。

该研究机构的试验可产生数 TB 的数据。为了分析来自基因组测序、蛋白质体、显微镜捕捉的高分辨率图像以及数字模拟的数据,该研究机构需要强大的计算资源,包括快速 CPU 和 GPU。

随着不同地点的研究人员开始开展合作,CMRI 认识到其当务之急是改变传统的数据管道管理方式。该研究机构希望优化流程,以提升性能、促进无缝协作和充分发挥数据的价值。

因此,该研究机构开始将整个研究所的生物信息学应用的功能整合到单一系统中,藉此确保研究人员能够更快地提供易于访问的信息。

Oracle Cloud Infrastructure and Oracle Cloud Infrastructure Data Science offer excellent performance and have up-to-date hardware and software, excellent technical support, a superior user interface, and priceless flexibility.

Pablo Galaviz澳大利亚儿童医学研究所高级数据科学家、生物信息学家

澳大利亚儿童医学研究所为何选择 Oracle

该组织评估了多家供应商的解决方案。CMRI 坚信,适合的云解决方案将助力该研究所几乎即时供应基础设施,随着需求的变化缩放系统,并提供物理数据中心和虚拟网络安全性。

考虑到 Oracle 云基础设施 (OCI) 的高度灵活性、可伸缩性和成本效益,该研究机构最终选择采用 Oracle 解决方案来应对当前挑战,使研究人员、数据科学家和运营团队能够共享、定制和重用研究数据。

此外,Oracle 能够与 CMRI 的业务和技术团队密切合作,一起将其各种孤立的旧式应用迁移至统一的 Oracle 云基础设施平台,这是他们选择 Oracle(尤其是 Oracle 云基础设施和 OCI 数据科学)的另一个重要原因。CMRI 还开始使用 OCI 视觉识别和 OCI 数据标签服务来开展试验。

解决方案

迁移至 OCI 之后,该研究机构可以利用大数据和机器学习功能来自动执行日常数据库任务、数据库合并、运营报告和批量数据处理。

此外,需要数据的人员可以更快地获取所需数据:CMRI 过去执行典型的数值模拟需要耗时约 30 天,而现在使用 OCI 数据科学平台只需要 5 天,而且不受当前正在运行的模拟数量的限制。

过去,该研究机构很难存储模拟、试验和研究所生成的数 TB 数据。现在,OCI 对所有静态数据进行加密,为有高输入/输出要求的数据提供各种存储选项,还提供独有的扩展/收缩功能。这些功能优势可赋能研究人员在特定时间摄取所有数据,并通过按需扩展计算来运行查询。

此外,研究人员和运营人员现在只需在 OCI 中集中上传和共享文件,从而轻松开展研究协作。

使用一个统一的云平台还有助于该研究机构打造工作流,产生可再现的结果。基于云的现代化改造为 CMRI 带来了变革性的机会,不仅使他们能够执行复杂的基因疗法研究,而且成本节省高达 25%。

已发布:2021年7月23日